I capperi hanno un sapore forte e penetrante; vengono raccolti e conservati in olio, aceto o sale. In cucina, sono usati per insaporire altri alimenti come primi piatti, secondi piatti, salse e condimenti. I migliori capperi sono quelli conservati in grosso sale marino; questo metodo di conservazione garantisce il mantenimento delle caratteristiche organolettiche senza ricorrere ad additivi invece aggiunti ai prodotti sottaceto. In virtù della loro notevole diffusione e uso assiduo in gastronomia, i capperi sono stati inclusi tra i Prodotti Agroalimentari Tradizionali (PAT) italiani. Estremamente deliziosi e conosciuti in tutto il mondo sono i capperi del Garda, l'area di produzione più settentrionale in Europa. I frutti del cappero sono utilizzati in modo simile ai boccioli o, per gli amanti, privati del gambo e come contorno. I capperi disponibili commercialmente possono essere in sale, in olio o in aceto. Qualitativamente parlando, i migliori sono quelli in sale anche se, a causa dell'eccesso di sodio, spesso vengono scartati al momento dell'acquisto a favore degli altri. Quello che molti ignorano è che l'eccessivo contenuto di sale può comunque essere rimediato sciacquando abbondantemente i capperi e mettendoli in un bagno di acqua fredda per circa dieci minuti; è anche buona regola non aggiungere sale ai piatti quando vengono arricchiti con capperi.